Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprsB0V2N1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms