Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms