Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Syndig1A2ANU3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms