Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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