Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms