Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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