Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk1bQ9Z2C6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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