Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cib1Q9Z0F4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms