Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms