Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mid2Q9QUS6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms