Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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