Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Trappc2lQ9JME7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms