Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms