Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms