Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gde1Q9JL56 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gde1Q9JL56 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms