Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Scamp5Q9JKD3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms