Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
OtofQ9ESF1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms