Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmgn3Q9DCB1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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