Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms