Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf6Q9DBU5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf6Q9DBU5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf6Q9DBU5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf6Q9DBU5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf6Q9DBU5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rnf6Q9DBU5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms