Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm18345-201ENSMUST00000200710 1390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm12202-201ENSMUST00000121196 811 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Riok3Q9DBU3 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms