Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp12Q9D9M2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms