Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chmp4bQ9D8B3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp4bQ9D8B3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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