Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx29Q9D3S3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx29Q9D3S3 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms