Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pramef12Q9D2F1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms