Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atxn3Q9CVD2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms