Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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PompQ9CQT5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PompQ9CQT5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PompQ9CQT5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PompQ9CQT5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PompQ9CQT5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PompQ9CQT5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PompQ9CQT5 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms