Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pkp2Q9CQ73 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pkp2Q9CQ73 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms