Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt23Q99PS0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms