Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 CT009494.1-201ENSMUST00000225121 1213 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 E130120K24Rik-201ENSMUST00000129910 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4Q99P72 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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