Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln4Q99NB8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ubqln4Q99NB8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ubqln4Q99NB8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms