Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KarsQ99MN1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms