Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprtQ99M80 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprtQ99M80 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms