Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ciao1Q99KN2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms