Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps4Q99KG7 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms