Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Apobec3Q99J72 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apobec3Q99J72 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apobec3Q99J72 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms