Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Cldn16Q925N4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Cldn16Q925N4 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Cldn16Q925N4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Cldn16Q925N4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Cldn16Q925N4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Cldn16Q925N4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Cldn16Q925N4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Cldn16Q925N4 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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