Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf4Q8VE97 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms