Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc92Q8VDN4 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc92Q8VDN4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms