Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ttc8Q8VD72 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ttc8Q8VD72 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc8Q8VD72 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms