Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Top1mtQ8R4U6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms