Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Colec12Q8K4Q8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Colec12Q8K4Q8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Colec12Q8K4Q8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Colec12Q8K4Q8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Colec12Q8K4Q8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Colec12Q8K4Q8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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