Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Abcf3Q8K268 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Abcf3Q8K268 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Abcf3Q8K268 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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