Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms