Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc178Q8CDV0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms