Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrif1Q8CDD9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms