Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Stbd1Q8C7E7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Stbd1Q8C7E7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms