Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp20Q8C6M1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms