Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cnot2Q8C5L3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms