Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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